تولد و دوران کودکی
آیت الله کمیلی خراسانی به سال ۱۳۶۰ هجری قمری مصادف با ۱۳۲۰ هجری شمسی در زیر سایه امامین همامین حضرت امام هادی و حضرت امام حسن عسکری صلوات الله علیهما در شهری که روشنی چشمان در انتظار نشسته حضرت مهدی (عج) شهر سامرا است در بیت علم و فضیلت، به جهانی که بسان مزرعه‌ای است برای جهان باقی پا نهاد.
پدر ایشان آیت الله شیخ حسن کمیلی از علمای خراسان بودند که در واقعه کشف حجاب عازم عراق شدند و سپس به دستور آیت الله میرزای شیرازی در سامرا اقامت گزیدند.
تحصیلات مقدماتی
معظم‌له چون در خانواده علم و فضیلت متولد شدند در سن پنج سالگی خواندن و نوشتن را در بیت پدر آغاز کرده و در سن ده سالگی رسما نزد والد معظمشان در سامرا دروس طلبگی را شروع کردند و در مدرسه علمیه مرحوم آیت الله مجدد میرزای شیرازی (ره) مشغول به تحصیل شدند.
در سن پانزده سالگی به نجف اشرف جهت ادامه تحصیلات حوزوی و کسب کمالات معنوی به جوار بارگاه ملکوتی مولی الموحدین امیرالمومنین صلوات الله علیه آمدند. در نجف در محله عماره و در مدرسه علمیه خلیلی کبری حجره گرفته و مشغول به فراگیری علوم شدند.
تحصیلات عالی در حوزه نجف
معظم‌له پس از یک سفر به ایران مجدد به عراق و نجف مراجعه کرده و به ادامه تحصیل مشغول شدند.
ایشان دروس مختلف را نزد اساتید و آیات عظام مرحوم آیت الله میرزا احمد تبریزی، مرحوم آیت الله شیخ محمد داوری اصفهانی، مرحوم آیت الله العظمی شهید میرزا علی تبریزی غروی، مرحوم آیت الله حاج شیخ مجتبی لنکرانی، آیت الله شیخ ابوالقاسم داوری اصفهانی، مرحوم آیت الله العظمی سید نصرالله مستنبط، مرحوم آیت الله شیخ عبد الرسول جواهری، مرحوم آیت الله العظمی آقا میرزا باقر زنجانی، حضرت آیت الله العظمی امام خمینی، مرحوم آیت الله العظمی حاج سید ابوالقاسم خویی آموخته و از محضر پر فیض‌شان بهره بردند.
تحصیلات عالی در حوزه قم
معظم‌له پس از مراجعت به ایران و اقامت در شهر مقدس قم، در درس حضرات آیات عظام مرحوم آیت الله العظمی گلپایگانی، مرحوم آیت الله العظمی مرعشی نجفی شرکت کرده و از دریای علم این بزرگواران نیز کسب فیض کردند.
تحصیلات تخصصی
علوم قضایی
همچنین در سال 1359 هجری شمسی در دانشکده عالی قضایی قم از محضر آیات عظام مرحوم حضرت آیت الله حاج شیخ علی مشکینی، مرحوم حجت الاسلام ناظمی بروجردی، حضرت آیت الله حاج شیخ عبدالله جوادی آملی، حضرت ایت الله شیخ محمد مومن قمی کسب فیض کردند.
علوم عقلی و معرفتی
همچنین معظم‌له در دروس اخلاق، فلسفه و عرفان محضر بزرگانی چون حضرات عظام مرحوم آیت الله حاج سید رضا صدر، مرحوم آیت الله سرابی، علامه حسن حسن زاده آملی و عارف کبیر استاد مرحوم حاج سید هاشم حداد شرکت و بهره معنوی بردند.